De danske sundhedsmyndigheder anbefaler, at børn vaccineres mod ni infektionssygdomme, og at piger desuden vaccineres mod livmoderhalskræft. Tidspunkter for vaccinationer og børneundersøgelse ses herunder
| Alder | Børneundersøgelse | Vaccination |
| 5 uger | • | |
| 3 måneder | difteri-tetanus-kighoste-polio-Hib 1 og PCV-1 | |
| 5 måneder | • | difteri-tetanus-kighoste-polio-Hib 2 og PCV-2 |
| 12 måneder | • | difteri-tetanus-kighoste-polio-Hib 3 og PCV-3 |
| 15 måneder | MFR 1 | |
| 2 år | • | |
| 3 år | • | |
| 4 år | • | MFR 2 |
| 5 år | • | difteri-tetanus-kighoste-polio revaccination |
| 12 år | MFR 2 og til piger HPV 1, 2 og 3 |
Børn født efter 1. april 2004 skal have MFR2 (2. vaccination mod mæslinger, fåresyge, røde hunde), når de bliver 4 år.
Børn født før 1. april 2004 skal ifølge programmet have MFR2, når de bliver 12 år, men kan faktisk blive vaccineret på ethvert tidspunkt, indtil de bliver 12 år.
Sygdomme, der er omfattet af det danske børnevaccinationsprogram:
1. Difteri, der bl.a. kan give alvorlig og livstruende halsbetændelse
2. Stivkrampe (tetanus), der kan fås efter sårinfektion
3. Kighoste (pertussis), der kan være alvorlig især hos helt små børn
4. Polio, der kan medføre blivende lammelser
5. Hib-infektion (Hæmophilus influenzae type b), der kan medføre meningitis (hjernehindebetændelse) eller strubelågsbetændelse
6. Pneumokoksygdom (PCV) (forårsaget af visse pneumokoktyper), der kan medføre blodforgiftning og meningitis
7. Mæslinger, MFR, (morbilli), der giver høj feber, hoste, forkølelse, øjenirritation og udslæt samt risiko for alvorlige komplikationer, fx lunge- eller hjernebetændelse
8. Fåresyge, MFR, (parotitis epidemica), der giver hævede spytkirtler og let feber og kan medføre meningitis (hjernehindebetændelse) eller testikelbetændelse samt varige mén
9. Røde hunde, MFR (rubella), der giver let feber, hævede kirtler og udslæt. Smitte af gravide inden for de første tre måneder af graviditeten kan medføre abort eller fosterskader
10. Livmoderhalskræft (Human papillomvirus-infektion, HPV). HPV-infektioner forekommer i over 100 forskellige undertyper. Nogle af disse typer forårsager vorter, andre typer forårsager kønsvorter (kondylomer), og visse kræftfremkaldende typer er årsag til livmoderhalskræft.
